近日,陜西省西安植物園植物多樣性監測與保護團隊在學(xué)術(shù)期刊Agronomy(IF=3.7,中科院二區)在線(xiàn)發(fā)表了題為“Complete plastomes of ten Rorippa species (Brassicaceae): Comparative analysis and phylogenetic relationships”的研究論文。
蔊菜屬(Rorippa)由約75種組成,隸屬于十字花科(Brassicaceae)。該屬物種主要生長(cháng)在北半球,除南極洲外,其他大陸均有分布。蔊菜屬的分類(lèi)和系統發(fā)育關(guān)系仍不確定,主要是由頻繁的雜交事件引起的該屬復雜的形態(tài)變異造成的。
圖1蔊菜屬質(zhì)體基因組圖譜
本研究表明蔊菜屬質(zhì)體基因組(圖1)在基因數量和順序、總長(cháng)度、基因組結構、密碼子使用、長(cháng)重復序列和SSR方面是保守的。14個(gè)突變熱點(diǎn)區可作為區分該屬植物的候選DNA條形碼?;谫|(zhì)體基因組和nrDNA ITS序列的系統發(fā)育樹(shù)清晰地表明,10個(gè)蔊菜屬物種在碎米薺族(Cardamineae)內呈現出單系(圖2)。然而,蔊菜屬內的種間關(guān)系及與近緣屬的屬間關(guān)系存在明顯的核質(zhì)不一致。我們推斷這種核質(zhì)不一致很可能是蔊菜屬內的種間雜交及與近緣屬的屬間雜交的結果。這些質(zhì)體基因組為蔊菜屬的物種鑒定、進(jìn)化歷史和系統發(fā)育研究提供了寶貴的信息。
圖2 基于質(zhì)體蛋白編碼基因和nrDNA ITS序列推斷蔊菜屬的系統發(fā)育關(guān)系
我園任婷博士為論文第一作者,黎斌研究員為論文通訊作者,尋路路和賈蕓參與相關(guān)研究工作,陜西省西安植物園(陜西省植物研究所)為第一完成單位。本研究得到了陜西省科學(xué)院科技計劃項目(2023K-25,2023K-48,2023K-14)和國家自然科學(xué)基金(32300314)的資助。
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